Кнопка "Delete" в главном окне VirtualBox удаляет виртуальную машину, которая вам больше не нужна. Все настройки ВМ будут удалены. Однако , образы дисков подключенные к ВМ будут сохранены; вы можете их удалить используя менеджер образов дисков (описан выше).
Вы не можете удалить машину пока она имеет снимок или находится в сохраненном состоянии.